Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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