Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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