Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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SYCP1Q15431 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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SYCP1Q15431 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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SYCP1Q15431 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYCP1Q15431 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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