Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD13P35453 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms