Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 THSD4-AS1-204ENST00000566268 468 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 KIAA1328-209ENST00000592521 1190 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZNF675-202ENST00000596211 581 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC023310.4-201ENST00000613130 650 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC110769.3-201ENST00000624567 1173 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC119674.1-209ENST00000642031 997 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 FBXO3-209ENST00000531080 1448 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZNF20-201ENST00000334213 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZNF438-203ENST00000375311 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SLC9B1P3-201ENST00000452667 1334 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR1K1-201ENST00000277309 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RNA5SP297-201ENST00000391029 113 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC015987.1-201ENST00000419211 804 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC002553.1-201ENST00000442828 802 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms