Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PPARGC1AQ9UBK2 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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