Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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CLDN19Q8N6F1 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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CLDN19Q8N6F1 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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CLDN19Q8N6F1 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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CLDN19Q8N6F1 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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