Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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