Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXF2Q12947 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms