Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXF1Q12946 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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