Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 MEP1B-204ENST00000581447 2308 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 SKA2-207ENST00000583380 583 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL353763.2-201ENST00000623489 1903 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ADH6-203ENST00000394899 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 PIK3AP1-203ENST00000371110 3151 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 KNG1-202ENST00000287611 1720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ADH4-209ENST00000508393 2151 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPN13Q12923 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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