Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 NYAP2-202ENST00000636099 5461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 TRPC5-201ENST00000262839 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 NBPF9-202ENST00000584027 5034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 OR4K17-202ENST00000641386 4886 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 FZD10-AS1-201ENST00000505807 10193 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 NNT-AS1-204ENST00000513560 4769 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 LINC02334-201ENST00000617568 4959 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms