Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133215.1-201ENST00000447344 342 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC023161.1-201ENST00000549532 420 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6762-201ENST00000613340 86 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms