Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TTC7AQ9ULT0 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.3 ms