Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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