Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
CCSER1Q9C0I3 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CCSER1Q9C0I3 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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