Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 PSMC1P8-201ENST00000536820 1296 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SP6Q3SY56 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SP6Q3SY56 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SP6Q3SY56 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC005323.1-203ENST00000585303 566 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 TBX18-AS1-201ENST00000423086 421 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SP6Q3SY56 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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