Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL021707.2-202ENST00000422408 1080 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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FOXD4Q12950 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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FOXD4Q12950 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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FOXD4Q12950 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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FOXD4Q12950 AC011405.1-203ENST00000510110 1067 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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FOXD4Q12950 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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FOXD4Q12950 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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FOXD4Q12950 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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