Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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