Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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ITGA9Q13797 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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ITGA9Q13797 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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ITGA9Q13797 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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ITGA9Q13797 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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ITGA9Q13797 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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ITGA9Q13797 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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ITGA9Q13797 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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ITGA9Q13797 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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ITGA9Q13797 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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ITGA9Q13797 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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ITGA9Q13797 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
ITGA9Q13797 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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