Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LMAN2Q12907 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms