Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TRAV6-201ENST00000390428 404 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC109638.1-201ENST00000417406 326 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RPL5P27-201ENST00000437011 881 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC009970.1-201ENST00000444873 432 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC122710.2-201ENST00000506093 596 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CRADD-210ENST00000552033 622 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC021755.3-201ENST00000560376 864 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC009063.2-201ENST00000563981 906 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PDCD6IPP2-205ENST00000565892 498 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC105227.1-201ENST00000586227 438 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC244196.5-201ENST00000617347 406 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 OR5AU1-204ENST00000641822 1197 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ZNF438-203ENST00000375311 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 NR1I3-202ENST00000367980 1403 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms