Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NMBRP28336 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NMBRP28336 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
NMBRP28336 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
NMBRP28336 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
NMBRP28336 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
NMBRP28336 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
NMBRP28336 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
NMBRP28336 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NMBRP28336 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NMBRP28336 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NMBRP28336 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NMBRP28336 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NMBRP28336 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NMBRP28336 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NMBRP28336 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NMBRP28336 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NMBRP28336 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NMBRP28336 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NMBRP28336 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NMBRP28336 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NMBRP28336 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NMBRP28336 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NMBRP28336 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NMBRP28336 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NMBRP28336 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NMBRP28336 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms