Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 DLGAP1-AS3-201ENST00000577649 1258 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 pRNA.12-201ENST00000614353 90 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 pRNA.3-201ENST00000615048 90 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 STC1-201ENST00000290271 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 FTH1P5-201ENST00000425761 545 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC114928.1-201ENST00000446516 415 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXA3O43365 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms