Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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CLIP4Q8N3C7 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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CLIP4Q8N3C7 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLIP4Q8N3C7 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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