Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IMPG1Q17R60 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms