Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
R3HDM1Q15032 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms