Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC093766.1-201ENST00000502606 866 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms