Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
EPHB4P54760 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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