Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL162724.2-201ENST00000426157 308 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 CHCHD7-215ENST00000523061 557 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 LINC00678-202ENST00000534757 798 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC138123.2-204ENST00000547432 721 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 LALBA-202ENST00000549817 1243 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 INO80-AS1-202ENST00000560178 444 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC015802.4-202ENST00000591967 474 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC016396.1-201ENST00000440189 328 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 GCSAM-202ENST00000460387 623 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 LINC02322-201ENST00000554773 338 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL664P-201ENST00000584239 305 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ANKRD42Q8N9B4 AC009950.1-209ENST00000595586 777 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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