Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AL583856.1-201ENST00000454078 1101 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
R3HDM1Q15032 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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