Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
ALCAMQ13740 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ALCAMQ13740 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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