Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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