Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 MTCO1P55-201ENST00000489829 745 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL3Q13618 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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