Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MCAMP43121 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MCAMP43121 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MCAMP43121 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MCAMP43121 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MCAMP43121 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MCAMP43121 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MCAMP43121 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MCAMP43121 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MCAMP43121 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MCAMP43121 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MCAMP43121 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MCAMP43121 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
MCAMP43121 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
MCAMP43121 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms