Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 OPRM1-205ENST00000414028 2485 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
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