Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apobec2Q9WV35 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms