Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPMQ9NSP4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms