Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8H7

Oma1, Metalloendopeptidase OMA1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oma1Q9D8H7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Oma1Q9D8H7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Oma1Q9D8H7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Oma1Q9D8H7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Oma1Q9D8H7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Oma1Q9D8H7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Oma1Q9D8H7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Oma1Q9D8H7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Oma1Q9D8H7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Oma1Q9D8H7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Oma1Q9D8H7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Oma1Q9D8H7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms