Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gtf2a1Q99PM3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms