Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp1b1Q99LU0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms