Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms