Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE42

Ankrd49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd49Q8VE42 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd49Q8VE42 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd49Q8VE42 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd49Q8VE42 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd49Q8VE42 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd49Q8VE42 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ankrd49Q8VE42 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms