Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLX4Q8IY92 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms