Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Catsper4Q8BVN3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms