Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARMIL1Q5VZK9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARMIL1Q5VZK9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms