Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDCA8Q53HL2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms