Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cldn34b4Q3V0X2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cldn34b4Q3V0X2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cldn34b4Q3V0X2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cldn34b4Q3V0X2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cldn34b4Q3V0X2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cldn34b4Q3V0X2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b4Q3V0X2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms