Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Crisp3Q03402 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms