Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tuba4aP68368 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tuba4aP68368 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tuba4aP68368 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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